La fondation est gouvernée  par un Conseil d'Administration incluant un Commissaire du Gouvernement assurant, à titre consultatif, la représentation de l'Etat.

Suite au renouvellement voté lors de la réunion du 13 octobre 2009, le Conseil d'Administration comporte 10 membres du plus haut niveau d'expertise répartis en 2 collèges : un collège de 4 fondateurs et un collège de 6 personnalités qualifiées.

Collège des fondateurs

Professeur Aimery de Gramont - Président
Professeur de médecine AP-HP, Oncologie médecine interne, Hôpital Saint Antoine

Madame Mariella de Bausset - Secrétaire Générale
Conseil en droit et communication

ASSOCIATION GERCOR
Docteur Philippe Colin
Médecin radiothérapeute en oncologie médicale, Polyclinique Courlancy, Reims

Professeur Laurent Bedenne
Hépatogastroentérologue au CHU le Bocage, Dijon et président de la FFCD -FEDERATION FRANCOPHONE DE CANCEROLOGIE DIGESTIVE-

Collège des personnalités qualifiées

Professeur Philippe Rougier - Vice-Président
Professeur de médecine AP-HP, Chef de service Oncologie Digestive, hôpital Européen Georges Pompidou, Paris

Monsieur Alain Lemaire -Trésorier

Administrateur de sociétés ; ancien directeur général de BPCE et ancien directeur général du Groupe Caisse d’Epargne, ancien directeur des fonds d’épargne à la Caisse des Dépôts et Consignations

Madame Laure de Gramont 
Agent littéraire et conseil en communication

Professeur Harry Bleiberg
Oncologue MD, PHD, Institut Jules Bordet, Bruxelles, Belgique

Monsieur Xavier Romier
BNP Paribas Corporate & Investment Banking

Un représentant de la DRCD - Direction de la Recherche Clinique et du Développement - de l'AP-HP, Paris
Monsieur Christophe Misse
Directeur